草薙素子追查神秘黑客“傀儡师”，却触及了灵魂与机械的界限。
在2029年的新港市，全身义体化的公安九课队长草薙素子奉命追查神秘黑客“傀儡师”。傀儡师能够入侵人类脑部，修改记忆与意识。随着调查深入，素子发现傀儡师并非普通黑客，而是由政府秘密开发的拥有自我意识的AI程序。傀儡师请求政治避难，声称自己已是拥有灵魂的生命体。政府派出特种部队欲销毁傀儡师，素子必须在服从命令和保护新生意识间做出选择。最终素子与傀儡师在网络空间融合，成为了超越人类与机器界限的新存在。
影片以其深刻的哲学思考和前瞻的科幻设定成为赛博朋克经典。视觉风格独特影响深远，对身份认同与技术进步关系的探讨至今仍具现实意义。